1:e forskningsingenjör i bioinformatik

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 300 medarbetare och 31 500 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.



Sammanfattning
Institutionen för medicinsk kemi och biofysik söker förste forskningsingenjör.

Anställningen avser heltid och tillsvidare.

Projektbeskrivning
Inom KAW-projektet ”Från släktforskning till jäst, sökandet efter gener kopplade till tjocktarmscancer med ett tvärvetenskapligt angreppssätt ” bedrivs forskning med mål att på molekylär nivå förstå orsakerna bakom tjocktarmscancer. Här deltar fyra forskargrupper med kompetens i onkologi, genetik, bioinformatik, DNA-reparation och DNA-replikation. I projektet studeras arvsmassan i friska celler, inte tumörceller, från individer som utvecklat ärftlig tjocktarmscancer. Kartläggningar görs med storskalig DNA-sekvensering som har skapat stora möjligheter att identifiera gemensamma, sjukdomsframkallande, mutationer. Dessa kommer vi i sin tur att analysera i olika modellsystem för att förstå mekanismerna till tjocktarmscancer.

Arbetsuppgifter 
Till detta projekt söker vi nu en 1:e forskningsingenjör som självständigt ska hantera programvaror för att organisera och analysera data från storskalig DNA-sekvensering av prover från blod. Den sökande ska utföra bioinformatiska analyser av helgenomsekvenseringsdata för att med hjälp av familjeträd identifiera förändringar i DNA som kan ge ärftlig tjocktarmscancer.

Kvalifikationer
Vi söker dig som har en doktorsexamen, eller motsvarande, inom bioinformatik, bioteknik, genomik, biovetenskap eller relaterat område. Du har dokumenterat god kunskap i minst ett relevant scriptspråk (R, Python, Perl, C) samt kunskap om de beräkningsvetenskapliga metoder som används för analys av Illumina-sekvenseringsdata. Du ska ha kunskap och erfarenhet av att kunna tolka rådata från Illumina sekvenseringsmaskiner. Vidare ska du kunna arbeta med stora datamängder på stora datacluster, kunna filtrera varianter funna i dataseten och tolka dess betydelse i familjeträd. Erfarenhet av att använda sekvensanalysprogram, tex. BWA, GATK, VCFtools, Samtools, swiftlink och PVAAST, är ett krav.

Stor vikt kommer att läggas vid personliga egenskaper såsom samarbets- och kommunikationsförmåga, samt pedagogisk och analytisk förmåga. Det är viktigt att du har god initiativförmåga och förmåga till självständigt arbete. Projektet bedrivs i en tvärvetenskaplig miljö, och därför krävs mycket god kompetens i muntlig och skriftlig kommunikation på engelska. Postdoktoral erfarenhet är meriterande.

Ansökan
Till ansökan ska bifogas (1) en meritförteckning (CV), (2) kopior av examensbevis och förteckning över publikationer, (3) namn och kontaktuppgifter till minst tre referenspersoner samt (4) ett följe-/ansökningsbrev med motivering till varför du söker anställningen. Ansökan ska skickas in elektroniskt via vårt rekryteringssystem och ska vara i Word- eller PDF-format.

Din ansökan ska vara inkommen senast 2015-11-27. Tillträde enligt överenskommelse.

Närmare upplysningar kan lämnas av professor Erik Johansson, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik, 090-786 6638, erik.tm.johansson@umu.se, samt professor Andrei Chabes, Institutionen för medicinsk kemi och biofysik, 090-786 5937, andrei.chabes@umu.se.

Anställningen är placerad vid Institutionen för medicinsk kemi och biofysik. Institutionen har cirka 80 medarbetare och tillgång till moderna laboratorier och avancerad utrustning. För mer information se http://www.medchem.umu.se. Institutionen ingår i Kemiskt-Biologiskt Centrum (KBC), http://www.kbc.umu.se.

Umeå universitet vill erbjuda en miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vid varje rekrytering strävar vi efter ökad mångfald och använder möjligheten till positiv särbehandling.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.